Hola @pabloweb y @felix_es35.
Efectivamente, el módulo de copia de seguridad de base de datos nativo de PrestaShop, aunque funcional para tiendas pequeñas o medianas, se queda corto con bases de datos grandes o cuando la necesidad es tener una réplica externa y automatizada. Está pensado para un backup rápido en el servidor, no para soluciones de recuperación ante desastres con integración en la nube.
El problema del 'execution timeout' es clásico con bases de datos que crecen mucho y los límites de PHP. Intentar subir esas copias de forma manual a la nube es tedioso y propenso a errores.
Para solventar esto de forma eficiente y sin tocar el core de PrestaShop 9.0.2 (que es lo más recomendable), lo ideal es usar un módulo dedicado. Estos módulos suelen tener su propio sistema de gestión de la memoria para la copia de seguridad y la capacidad de conectarse a APIs de servicios en la nube. Te recomiendo este módulo que permite hacer un backup de base de datos en Google Drive y otros servicios como Dropbox, de forma programada y totalmente automática.